工業級殼聚糖具有較強的抗真菌性的事實已為人熟知。Alen等人對46種真菌的抑菌實驗發現工業級殼聚糖對薄狀菌屬、脈孢菌屬、座線孢菌屬等32種真菌具有抵制作用。一般地，當工業級殼聚糖的濃度達到100μg/mL時，即可表現出抗真菌性，且抗真菌性與工業級殼聚糖顆粒的大小成反比。工業級殼聚糖的聚合度對其抗真菌性有較大的影響，聚合度降低，則工業級殼聚糖所能抵制的真菌種類減少，但抵制的程度加強。Kendra等人還發現，七聚體的工業級殼聚糖具有較強的抗真菌性。
　　工業級殼聚糖對大腸桿菌、熒光假單胞菌、金黃色葡萄球菌、枯草桿菌等有良好的作用，并且還能低制鮮活食品的生理變化。工業級殼聚糖天然無毒，適用于偏酸性及含蛋白質少的食品保鮮，遇高分子和離子性復合物可凝集。例如水果的防腐保鮮，用量為醋酸百分之0.1+工業級殼聚糖百分之0.05-0.1。

　　工業級殼聚糖的衍生物也有很好的抗菌性，甚至強于工業級殼聚糖。